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Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構(gòu)建
品牌：Rubicon Genomics
貨號(hào)：R300669
規(guī)格：24Rxns
Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構(gòu)建
單細(xì)胞起始的DNA測序文庫構(gòu)建
SMARTer® PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit
· 高重現(xiàn)性和準(zhǔn)確性：可用于CNV、SNV和非整倍體檢測
· 在SNV和CNV檢測方面優(yōu)于MDA技術(shù)
· 三小時(shí)的工作流程，手動(dòng)操作時(shí)間不到30分鐘
· 均勻的高覆蓋率，低的等位基因插入率和脫扣率
應(yīng)用：
適用于以下細(xì)胞類型的文庫制備：
· 癌癥研究：循環(huán)腫瘤細(xì)胞（CTC）,激光捕獲顯微切割（LCM）細(xì)胞或DNA，
以及細(xì)針抽吸（FNA）細(xì)胞；
· 生殖健康研究：胚胎細(xì)胞和循環(huán)胎兒細(xì)胞；
· 發(fā)育生物學(xué)：胚胎細(xì)胞，干細(xì)胞和稀有細(xì)胞；
· 宏基因組學(xué)和微生物學(xué)：微生物細(xì)胞，微生物組和環(huán)境樣品。
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| 產(chǎn)品說明： | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一種旨在從單細(xì)胞中生成高質(zhì)量的DNA文庫，以便在Illumina平臺(tái)進(jìn)行測序的試劑盒。該試劑盒基于PicoPLEX技術(shù)，優(yōu)化用于檢測拷貝數(shù)變異 (CNVs)、單核苷酸變異 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和結(jié)構(gòu)變異 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV檢測中表現(xiàn)出比MDA技術(shù)更好的性能。 SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要單獨(dú)購買。 PicoPLEX WGA是一種在被廣泛用于檢測單細(xì)胞中CNV的全基因組擴(kuò)增（WGA）技術(shù)。初，PicoPLEX技術(shù)主要用于高再現(xiàn)性的檢測非整倍體異倍性和CNV。為了滿足準(zhǔn)確檢測SNV的需求，對(duì)PicoPLEX WGA技術(shù)中的酶、引物和protocols進(jìn)行了進(jìn)一步優(yōu)化，不僅提升了擴(kuò)增的覆蓋度、*性、準(zhǔn)確性，同時(shí)提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率，并且保持了高重現(xiàn)性。 SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定細(xì)胞或非固定細(xì)胞起始，只需簡單的4步操作流程，即可在3小時(shí)內(nèi)完成Illumina NGS文庫的構(gòu)建，且手動(dòng)操作時(shí)間非常短。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA HT dual index kits | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMARTer DNA HT dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列對(duì)應(yīng)的index引物，多可提供384種不同的雙端index，用于樣本混合測序時(shí)的區(qū)分。其中index引物預(yù)先分裝在4個(gè)的不同條形碼標(biāo)記的index微孔板中，每個(gè)微孔板可提供不同的96種index組合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每個(gè)孔提供的量足夠進(jìn)行一次測序反應(yīng)；另一種是一套中有24個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)管，每個(gè)反應(yīng)管中包含不同的雙端index組合（Code No.R400664），且每個(gè)反應(yīng)管（24N）提供的量足夠進(jìn)行兩次測序反應(yīng)。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA unique dual index kits | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMARTer DNA unique dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對(duì)應(yīng)的index引物，多可提供96種不同雙端index，用于樣本混合測序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的4組各24個(gè)單獨(dú)的管中，其中每組可提供24種不同index引物組合（Code No.R400665-R400668）。每個(gè)index引物管（24U Sets A-D）提供的量足夠進(jìn)行兩次測序反應(yīng)。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA single index kits | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMARTer DNA single index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對(duì)應(yīng)的index引物，可提供24種單端index，用于樣本混合測序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的2組各12個(gè)單獨(dú)的管中，其中每組可提供12種不同index引物組合（Code No.R400695和R400697）。每個(gè)index引物管（12U Sets A-B）提供的量足夠進(jìn)行8次測序反應(yīng)。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 歡迎您致電 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229 華雅干細(xì)胞-客服中心：023-630105781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 圖1. SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技術(shù)。 PicoPLEX Gold的技術(shù)概要。通過step1裂解細(xì)胞獲得gDNA，通過隨機(jī)引物進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增 (step 2)，然后進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增得到測序文庫（step 4）。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 圖2. PicoPLEX Gold的主要特點(diǎn)：高覆蓋度，高均勻性，和高重現(xiàn)性 (與A產(chǎn)品技術(shù)相比)。 Panel A. 圖中顯示在不同深度的測序中覆蓋的堿基數(shù) (～35M read pairs，PE 2 × 150 bp) 。PicoPLEX Gold在較低深度的覆蓋度與A產(chǎn)品 (MDA) 相似，在較高深度的覆蓋度高于A產(chǎn)品（MDA）。 Panel B. 以gDNA樣本 (NA12878) 和單細(xì)胞樣本 (GM12878) 起始，使用PicoPLEX Gold和A產(chǎn)品進(jìn)行全基因組擴(kuò)增。相比較于MDA，PicoPLEX Gold顯示出更均勻的覆蓋度。 Panel C. 評(píng)估覆蓋度的重現(xiàn)性。與A產(chǎn)品 (右) 相比，PicoPLEX Gold (左) 的在兩個(gè)單細(xì)胞群之間的*性明顯更好。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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圖3. 使用PicoPLEX Gold進(jìn)行高質(zhì)量單核苷酸變異（SNV）檢測。
歡迎您致電 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229 華雅干細(xì)胞-客服中心：023-630105781 Rubicon擁有ThruPLEX®和PicoPLEX®技術(shù)。特殊的引物或接頭設(shè)計(jì)，能以微量DNA樣本起始構(gòu)建下一代測序文庫。 ThruPLEX DNA-seq Kit 更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina® 的 NGS 平臺(tái) 更高的通量–多達(dá) 96 個(gè) index 微量起始樣品（50 pg – 50 ng），更高性能 快速簡單的實(shí)驗(yàn)方法：一根管或孔中，僅三步反應(yīng)，約 2 小時(shí)時(shí)間，無需轉(zhuǎn)移 適用于所有主要的靶向富集平臺(tái)–安捷倫 SureSelect® Enrichment，羅氏 NimbleGen® SeqCap EZ®，IDT xGEN® LockDown® probes ThruPLEX Plasma-seq Kit 專為血漿游離DNA設(shè)計(jì) 專為cfDNA設(shè)計(jì)：修復(fù)及連接試劑配方更新，方法優(yōu)化 高品質(zhì)NGS文庫：在寬廣的GC含量范圍內(nèi)，可以達(dá)到高檢測再現(xiàn)性 起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量 快速簡便：單管、2小時(shí)、3步操作步驟，無需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟 應(yīng)用領(lǐng)域：液體活檢、ctDNA、靶向測序等領(lǐng)域文庫構(gòu)建 兼容自動(dòng)化平臺(tái)：Beckman® FXP Workstation Takara&Clontech NGS系列產(chǎn)品
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